系统自动SSR代码管理功满足中国民航现行的SSR代码分配规定的要求。系统将区内、区外SSR代码段划分为可使用、已分配、冻结、保留四种SSR代码类型，并在此基础上按照最近最久未使用原则对SSR码进行合理分配。
已经为航班自动分配的SSR代码，当飞行计划回退或进入到不分配代码状态时，已经分配的SSR代码应当释放， 系统将自动回收之前已经为该航班分配的SSR，包括以下几种情况：
1. 航班状态回退至未来、准备状态，或进入飞出、落地、结束、取消等状态。
2. 航班变更起飞时间推迟，不满足提前T分钟分配SSR的时间条件。
3. SSR分配给该航班T小时仍未被释放(长时间占用)。
4. 手动相关的系统航迹的SSR码不同于飞行计划的SSR码。
5. FDD/SDD直接修改航班的SSR为别的SSR码。
当系统工作在备份系统模式下时，系统将自动关SSR代码自动管理功能，系统可以从外接的动态飞行数据接口获取主用系统为航班分配的SSR信息并保留该信息，当备份系统切换为主用系统使用后，系统将自动开启SSR代码自动分配功能，并避免重复为之前主用系统已经为航班分配了SSR码的航班再度分配SSR码。
系统中已相关的航空器更改SSR代码为7500、7600、7700时，不自动去除相关。
l HIJ（7500）：非法干扰
l RCF（7600）：无线电失效
l EMG（7700）：紧急状态
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