二代测序数据分析:[1]quality control
从事生物信息学分析的学生和工作人员都会接触到二代测序数据,我们从测序公司拿到所需要的数据之后,首先最关心的问题就是测序数据的质量好不好,本文介绍一下如何对二代测序数据进行质量分析(QC) 工具/原料 linux系统:ubuntu 或者 服务 fastqc 方法/步骤 1 安装fastqc注意将fastqc加入到系统环境变量中,以便于在终端或命令行中直接运行具体安装方法参考fastqc官方手册 2 在命令行中直接运行命令fastqc [-o output dir] [--(no)extract