pycirclize库是一个用于制作环形图的工具，可以帮助用户展示环形结构数据的关系。本文将介绍如何在Python中使用pycirclize制作精美的环形图。

pycirclize的环形图主要的应用场景有：

• 基因组数据：通常用于比较不同样本的基因表现、突变等。

• 网络数据：对于可视化关系或交互非常有效，尤其是使用和弦图。

• 比较数据：可用于跨参数（如销售或绩效指标）比较。

• 时间序列数据：可以表示一段时间内的模式，尤其是对于季节性数据。 

• 多维数据比较：可以表示跨类别的多个测量值的数据。圆形热图可用于显示变量之间的交互作用。

画图包安装

pip install pycirclize

pycirclize 的扇区和轨道

Pycirclize包中的每个扇区代表圆周上的一个划分，数据中的“扇区”则表示各种类别或分组。在显示数据的每个扇区中，都存在称为“轨道”的同心环，可以呈现多层信息。

了解扇区和轨道，稍后我们将使用新数据看看如何使用扇区和轨道。

from pycirclize import Circos
# Initialize circos sectors
sectors = {"cat A": 15, "Cat B": 15, "Cat C": 12, "Cat D": 20, "Cat E": 10}
circos = Circos(sectors, space=6) #space =6, the space between each sector
for sector in circos.sectors:
   # Plot sector axis & name text
   sector.axis(fc="pink", ls="dashdot", lw=2, ec="green", alpha=0.5, )
   sector.text(f"Sector: {sector.name}={sector.size}", size=12) #size of the text on figure


fig = circos.plotfig()

多个圆环数据呈现

轨迹是圆内的同心环，每个圆环显示数据的不同方面或测量值。扇区提供分类细分，而轨迹提供数据细节层，允许在单个圆形图中查看数据集的视图。

可以在扇区半径范围 （0 – 100） 内自由放置轨迹。

from pycirclize import Circos

# Initialize circos sectors
sectors = {"cat A": 15, "Cat B": 15, "Cat C": 12, "Cat D": 20, "Cat E": 10}
circos = Circos(sectors, space=5)


for sector in circos.sectors:
   # Plot sector axis & name text
   sector.axis(fc="none", ls="dashed", lw=2, ec="Blue", alpha=0.3)
   sector.text(f"{sector.name}={sector.size}", size=10)
   # Set Track01 (Radius: 80 - 100)
   track1 = sector.add_track((80, 100))
   track1.axis(fc="red", alpha=0.2)
   track1.text(track1.name)
 # as you can see the track radius is kept from 80 to 100 and then 
# next track is kept at 75 so that there is a gap of 5 between the tracks
# we can reduce or increase it, as done in the next tracks
   # Set Track02 (Radius: 50 - 75)
   track2 = sector.add_track((50, 75))
   track2.axis(fc="cyan", alpha=0.2)
   track2.text(track2.name)
   # Set Track03 (Radius: 20 - 45)
   track3 = sector.add_track((20, 48))
   track3.axis(fc="lime", alpha=0.2)
   track3.text(track3.name)
   #Set Track04 (Radius 5 -15)
   track4 = sector.add_track((5, 15))
   track4.axis(fc="yellow", alpha=0.2)
   track4.text(track4.name)
fig = circos.plotfig()

呈现更复杂的图形

from pycirclize import Circos
import numpy as np
np.random.seed(0)

sectors = {"A": 10, "B": 15, "C": 12, "D": 20, "E": 15} 
circos = Circos(sectors, space=5) #initilaise 
for sector in circos.sectors:
   # Plot sector name
   sector.text(f"Sector {sector.name}", r=106, size=12) 
   # r = 106 place #the text, if we change the value the texts move 
   # Create x positions & randomized y values for data plotting
   x = np.arange(sector.start, sector.end) + 0.5 
   #sector.start 
   #is 0 and ends at the value of sector defined ,for a it is 10, B is 15 
   y = np.random.randint(0, 100, len(x))
   # Plot line
   line_track = sector.add_track((75, 100), r_pad_ratio=0.1)
   line_track.axis(fc='yellow')
   line_track.xticks_by_interval(1)
   line_track.line(x, y)
   # Plot points
   points_track = sector.add_track((45, 70), r_pad_ratio=0.1)
   points_track.axis(fc='blue')
   points_track.scatter(x, y)
   # Plot bar
   bar_track = sector.add_track((15, 40), r_pad_ratio=0.1)
   bar_track.axis()
   bar_track.bar(x, y)

fig = circos.plotfig()