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北鲲云SaaS平台为生物制药研发进程带来“加速度”

原创 公有云实践 作者:beikun_北鲲云 时间:2021-09-17 15:14:56 0 删除 编辑


 

统计数据显示 , 新药从研发到上市的平均时间是  13 年左右,投入非常巨大。 在这个过程中,需要大量 的 计算,大量的研究 环节都需要计算的支持 。 可是 在过去的很长 时间里,受技术方面的限制, 算力达不到 研究要求, 这是 导致 新药研发耗时 漫长的原因所在。目前 , 在 北鲲云 SAAS平台 的 支持下, 算力 问题已经得到了有效 解决 ,新药研发效率 也因此 极大提升。

 

据了解 , 在 生物 药品 的开发环节中, 怎么找到先导化合物、进行靶点的识别是非常 关键的步骤 ,并且要完成这些工作都是需要反复 计算的 ,但是 由于不少研究机构的计算能力极其有限, 怎样找到药物 的关键 成分 ,进而合成 药物有非常大随机性在里面, 更有 人士称 要 靠运气。所以在很早之前 就有人呼吁有关机构进行算 能 的研究, 以 使得医药研发进程更加的顺利 。北鲲云在这方面做了 很多的工作,并取得了可喜成果。

 

近两年 , 随着 疫情的爆发,生物 疫苗等药物的研发越发 受到关注, 这种药物 的研究需要 三期实验,大概 会耗费 一年到两年的时间。在研发过程中很多 机构会 采用  GPU ,借助于 AI的筛选 技术来使得 研发进程加速。生命科学计算有 多种 类型, 其中 最重要的一种就是生物信息学, 也就是大家常说 的基因序列分析, 它的 主要作用就是对某些成分 和 结构进行比对 、 结合。

 

在进行 生物药物的研发过程中 , 所 涉及 到的 计算量之所以非常庞大,一个 重要原因是 要模拟和完全了解一个细胞的详细情况,和大量细胞的 共性, 要 完成 这种计算是非常难的,据悉有 很多机构已经 将分子动力学的一类计算并行度扩展到 10亿个分子级别 ,这样的 级别对计算能力的要求之高可想而知。 出现了北鲲云 SAAS 和 AI机器学习以后, 通过 大量的筛选比对,同时 结合 全世界的开源医药分子库 数据 , 可以实现 大量知识图谱的筛选 ,研发过程 就会简单的多。

 

据了解,北鲲云可以结合企业的高性能计算集群情形,为 其提供 私有云、混合云以及直接上云等模式,一方面可以 有效地提升 企业 或者研究机构的算能, 同时也 可以很好 地降低企业的运维成本,北鲲云超算平台在短短数年时间就在众多 的 高校和科研所进行了广泛 应用 。北鲲云超算平台接入主流公有云资源,根据用户的使用习惯不同,推出 了 持可视化、命令行和工作站等多种作业提交方式。为 给不同的行业 提供 便利, 北鲲云超算平台还预装了对应的专业软件,进一步降低了用户使用高性能计算服务的门槛。

 

目前, 针对 靶点的识别和跟化合物的筛选依然是 生物 制药 领域的研究重点 ,在北鲲云这类企业 的支撑下,这个进程无疑会更加顺利!

 


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