根据企业信息化建设的现状，可以将六西格玛与ERP质量子系统的集成分为3个层次：数据集成、方法集成和功能集成。
(1)数据集成：在数据集成层次上，六西格玛方法利用现有的ERP质量子系统提供的数据和信息，人为地对这些数据和信息进行分析，其分析工具主要是配合六西格玛的DMAIC过程所提供的不同阶段的统计工具。
(2)方法集成：在方法集成层次上，除了利用数据集成阶段所利用的信息基础外，应当将六西格玛的统计思想或者算法直接集成到ERP质量子系统中，这样可以在不需要人工分析的时候自动获取部分分析结果。
(3)功能集成：功能集成层次应当是六西格玛与ERP质量子系统集成的最高层次，在这个层次上，六西格玛分析成为与ERP质量子系统并行的一个模块，他可以自动采集质量信息、分析质量缺陷原因、反馈改进措施、改善生产流程。
以上面提到的“有N道生产工序的流程制造企业”的在制品检验为例，可以分析以上三种不同层次的集成模式：首先建立一个在制品质量检验表，以采集各道工序的质量数据，如果在第M（M）假设发现导致第M道工序产品质量问题的原因是某零件的尺寸不匹配，则需要分析导致零件尺寸问题的原因：人工操作的误差、机床的刀具磨损、零件材料自身在加工过程中的变形等，最后将这些原因汇总生成原因参照表，并统计出这些原因各自的原因级别。
在数据集成层次要注意筛选出与质量问题紧密联系的数据，对于那些效益提升空间较小的因素，可在以后的改进中加以考虑。
如果是方法集成层次，则6σ集成分析模式会自动根据系统设置的算法，统计出导致质量问题的原因级别。
到功能集成层次上，6σ集成分析模式会自动收集与工序质量问题相关的原因，并进行后续处理，当然这些数据是在ERP中实际产生的，系统只需提供一些“关键点开关”供管理人员作判断使用。
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