现实中，精益六西格玛咨询的实施会有很多困难和障碍。处理不当会导致执行失败。以下是天行健精益六西格玛顾问总结的在实施精益六西格玛咨询时需要注意的一些问题:
1.不要机械地复制精益六西格玛模型
虽然现在理论界有很多精益六西格玛模型，但是在企业的实际应用过程中很难按照设计好的方式应用精益六西格玛工具，往往需要根据企业的实际情况重新设计实施方案。
2.需要一个设计良好的项目管理系统
精益和六西格玛有各自的项目运作模式。精益是每日持续改进，而六西格玛有完整的DMAIC或DFSS项目操作流程。精益六西格玛作为两种方法融合的产物，需要有一个兼顾精益生产和六西格玛特点的项目管理体系，以保证精益六西格玛成果在企业中的延续和发展。
3.重视跨企业项目实施
企业在解决交付周期问题时，往往会涉及到其上下游企业，需要完善整个供应链。因此，项目的范围可能不仅是跨部门的，而是跨企业的。这种跨企业项目模式面临许多挑战:
首先，上下游企业之间往往存在利益冲突。当这种冲突无法弥合时，项目很可能会遇到瓶颈。
其次，上下游企业很可能在不同的城市甚至不在同一个国家，这使得项目成员之间的沟通陷入困境。精益/六西格玛中的许多团队行动不能仅通过电话和电子邮件来执行。频繁出差增加了项目成本，降低了项目的可行性。
最后，不同的企业对精益六西格玛的执行和理解程度不同。试想一下，如果供应商只是没有实施精益六西格玛，他们很难为整个项目提供必要的支持。精益六西格玛的概念和技能在项目实施中需要一定的培训和经验积累，因此再次开始培训多个项目成员是一项非常具有挑战性的任务。
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