解决：1、始export JAVA_HOME=D:Program Filesjavajdk，这样配置其实会出现两个错误，首先，Unix不支持空格，我们需要重新安装JDK，把它安装在D:Java中。

2、我们不能直接写window的路径，应该改成/cygdrive/d/Program Files/Java/jdk1.6.0_18

3、在Cygwin中创建一个指向JAVA_HOME的软连接，之后修改hadoop-env.sh中的JAVA_HOME使其指向创建的软连接，这样问题最终解决了。

在/usr/local中执行如下的命令：

ln -s  D:/Java/jdk1.6.0_18  jdk1.6.0_18

之后ls，就会看到新建的软连接了，最后修改hadoop-env.sh中的配置。

export JAVA_HOME=/usr/local/jdk1.6.0_18

二、在执行bin/start-all.sh中出现了“/home/Lenovo/hadoop-1.2.1/libexec/../conf/hadoop-env.sh: line 1: $'357273277#': command not found”问题。查找了没有发现hadoop-env.sh中没有乱码。用notepad将编码由utf-8更改为ansi格式，就OK了。