1、聚类
常用的包:
fpc,cluster,pvclust,mclust
基于划分的方法:
kmeans, pam, pamk, clara
基于层次的方法:
hclust, pvclust, agnes, diana
基于模型的方法:
mclust
基于密度的方法:
dbscan
基于画图的方法:
plotcluster, plot.hclust
基于验证的方法:
cluster.stats
2、分类
常用的包:
rpart,party,randomForest,rpartOrdinal,tree,marginTree,
maptree,survival
决策树:
rpart, ctree
随机森林:
cforest, randomForest
回归,
Logistic回归, Poisson回归: glm, predict, residuals
生存分析:
survfit, survdiff, coxph
3、关联规则与频繁项集
常用的包:
arules:支持挖掘频繁项集,最大频繁项集,频繁闭项目集和关联规则
DRM:回归和分类数据的重复关联模型
APRIORI算法,广度RST算法:apriori,
drm
ECLAT算法:
采用等价类,RST深度搜索和集合的交集: eclat
4、序列模式
常用的包:
arulesSequences
SPADE算法:
cSPADE
5、时间序列
常用的包:
timsac
时间序列构建函数:
ts
成分分解:
decomp, decompose, stl, tsr
6、统计
常用的包: Base
R, nlme
方差分析: aov,
anova
密度分析:
density
假设检验:
t.test, prop.test, anova, aov
线性混合模型:lme
主成分分析和因子分析:princomp
7、图表
条形图:
barplot
饼图:
pie
散点图:
dotchart
直方图:
hist
密度图:
densityplot
蜡烛图, 箱形图
boxplot
QQ
(quantile-quantile) 图: qqnorm, qqplot, qqline
Bi-variate
plot: coplot
树:
rpart
Parallel
coordinates: parallel, paracoor, parcoord
热图,
contour: contour, filled.contour
其他图:
stripplot, sunflowerplot, interaction.plot, matplot,
fourfoldplot,
assocplot,
mosaicplot
保存的图表格式:
pdf, postscript, win.metafile, jpeg, bmp, png
8、数据操作
缺失值:na.omit
变量标准化:scale
变量转置:t
抽样:sample
堆栈:stack,
unstack
其他:aggregate, merge,
reshape
9、与数据挖掘软件Weka做接口
RWeka:
通过这个接口,可以在R中使用Weka的所有算法。